CpG岛定义问题

问题描述：

为什么要叫CpG岛？，那个p是怎么来的？是不是只看一条链上的CG，而不是双链间的CG配对？CG配对是通过三条氢键连接，单条链中才是C和G之间由磷酸连接？
我的具体意思是不明白为什么要要叫CpG岛，而不是叫CG岛？？？p是怎么来的？？？

问题解答：

本来核酸的书写规则规定在各碱基之间需要加一个小写的p作为相邻两个核苷酸靠磷酸二酯键相连接的标志，后来大家都喜欢省略掉那个p，也就约定俗成了。

例如，我们一般写的序列是：TATA，而最规范的写法应该是TpApTpA。

CpG岛（CpG islands）是指DNA上一个区域，此区域含有大量相联的胞嘧啶（C）、鸟嘌呤（G），以及使两者相连的磷酸酯键（p）。哺乳类基因中的启动子上，含有约40%的CpG岛（人类约70%）。一般CpG岛的长度约300到3000个碱基对（bp）。

常用的正式定义是指一个至少含有200bp的区域，其中GC所占比例超过50%，且CpG的观察值／预测值比例必须高于0.6。此霸部份的CpG岛与基因相连，可用来作为限制酶的辨识位置。

http://baike.baidu.com/view/985959.html?wtp=tt

CpG岛定义

GC岛就是真核生物转录起始区域的一段富含GC的序列，位于CATbox附近，可以调控转录的效率。
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定义为Y值大于0.6并且GC含量大于50%的200bp序列区域。只有符合以上标准,才输入结果。CpG岛经常在脊椎动物基因的5'区域发现,因此,这个程序可用来在基因组序列中查找潜在的基因。